Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UHRF1Q96T88 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms