Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CRBNQ96SW2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CRBNQ96SW2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms