Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PIGSQ96S52 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIGSQ96S52 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIGSQ96S52 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PIGSQ96S52 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIGSQ96S52 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIGSQ96S52 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PIGSQ96S52 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PIGSQ96S52 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PIGSQ96S52 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIGSQ96S52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms