Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGLYRP2Q96PD5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PGLYRP2Q96PD5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms