Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCLT1Q96NL6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCLT1Q96NL6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms