Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RILPQ96NA2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RILPQ96NA2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RILPQ96NA2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms