Protein–RNA interactions for Protein: Q96N77

ZNF641, Zinc finger protein 641, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF641Q96N77 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF641Q96N77 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms