Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP4Q96MN2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP4Q96MN2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP4Q96MN2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP4Q96MN2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP4Q96MN2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP4Q96MN2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP4Q96MN2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP4Q96MN2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP4Q96MN2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP4Q96MN2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP4Q96MN2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms