Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM20AQ96MK3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms