Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC138Q96M89 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms