Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIMPOLQ96LW4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRIMPOLQ96LW4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRIMPOLQ96LW4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRIMPOLQ96LW4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRIMPOLQ96LW4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRIMPOLQ96LW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRIMPOLQ96LW4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRIMPOLQ96LW4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRIMPOLQ96LW4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRIMPOLQ96LW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRIMPOLQ96LW4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms