Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT74Q96LB3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT74Q96LB3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms