Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALPK3Q96L96 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms