Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITCHQ96J02 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms