Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM3Q96HU1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms