Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
LTV1Q96GA3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
LTV1Q96GA3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LTV1Q96GA3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms