Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP3Q96DZ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIP3Q96DZ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms