Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATG4CQ96DT6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG4CQ96DT6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATG4CQ96DT6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms