Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM143Q96AN5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms