Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FUBP1Q96AE4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FUBP1Q96AE4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms