Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102AQ96A19 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms