Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRN2Q92932 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms