Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EDAQ92838 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDAQ92838 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDAQ92838 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDAQ92838 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDAQ92838 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDAQ92838 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDAQ92838 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDAQ92838 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDAQ92838 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDAQ92838 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDAQ92838 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDAQ92838 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDAQ92838 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDAQ92838 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDAQ92838 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDAQ92838 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDAQ92838 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDAQ92838 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDAQ92838 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDAQ92838 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDAQ92838 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDAQ92838 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDAQ92838 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDAQ92838 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDAQ92838 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDAQ92838 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDAQ92838 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDAQ92838 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EDAQ92838 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDAQ92838 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDAQ92838 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EDAQ92838 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EDAQ92838 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EDAQ92838 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EDAQ92838 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDAQ92838 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EDAQ92838 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EDAQ92838 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EDAQ92838 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDAQ92838 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDAQ92838 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDAQ92838 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDAQ92838 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDAQ92838 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDAQ92838 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDAQ92838 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDAQ92838 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDAQ92838 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDAQ92838 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDAQ92838 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EDAQ92838 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDAQ92838 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDAQ92838 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDAQ92838 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDAQ92838 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDAQ92838 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDAQ92838 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDAQ92838 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDAQ92838 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDAQ92838 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDAQ92838 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDAQ92838 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDAQ92838 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDAQ92838 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDAQ92838 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDAQ92838 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDAQ92838 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EDAQ92838 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDAQ92838 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDAQ92838 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EDAQ92838 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EDAQ92838 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDAQ92838 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDAQ92838 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDAQ92838 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDAQ92838 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDAQ92838 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDAQ92838 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDAQ92838 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDAQ92838 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDAQ92838 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDAQ92838 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDAQ92838 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDAQ92838 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDAQ92838 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EDAQ92838 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDAQ92838 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDAQ92838 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDAQ92838 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDAQ92838 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDAQ92838 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDAQ92838 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDAQ92838 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDAQ92838 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDAQ92838 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDAQ92838 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDAQ92838 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDAQ92838 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDAQ92838 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms