Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNRQ92752 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TNRQ92752 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNRQ92752 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNRQ92752 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNRQ92752 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNRQ92752 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNRQ92752 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TNRQ92752 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TNRQ92752 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNRQ92752 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNRQ92752 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNRQ92752 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNRQ92752 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNRQ92752 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNRQ92752 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TNRQ92752 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNRQ92752 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNRQ92752 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNRQ92752 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNRQ92752 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNRQ92752 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNRQ92752 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNRQ92752 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNRQ92752 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNRQ92752 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNRQ92752 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNRQ92752 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNRQ92752 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNRQ92752 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TNRQ92752 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNRQ92752 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TNRQ92752 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNRQ92752 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNRQ92752 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNRQ92752 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNRQ92752 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNRQ92752 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNRQ92752 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNRQ92752 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNRQ92752 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNRQ92752 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNRQ92752 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNRQ92752 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNRQ92752 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TNRQ92752 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNRQ92752 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNRQ92752 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNRQ92752 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNRQ92752 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNRQ92752 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TNRQ92752 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNRQ92752 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNRQ92752 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNRQ92752 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNRQ92752 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TNRQ92752 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNRQ92752 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNRQ92752 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNRQ92752 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNRQ92752 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNRQ92752 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNRQ92752 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNRQ92752 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNRQ92752 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNRQ92752 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNRQ92752 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNRQ92752 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNRQ92752 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNRQ92752 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNRQ92752 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TNRQ92752 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNRQ92752 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNRQ92752 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNRQ92752 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNRQ92752 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNRQ92752 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNRQ92752 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TNRQ92752 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNRQ92752 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNRQ92752 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNRQ92752 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TNRQ92752 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNRQ92752 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNRQ92752 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNRQ92752 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNRQ92752 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TNRQ92752 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNRQ92752 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNRQ92752 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNRQ92752 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNRQ92752 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNRQ92752 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNRQ92752 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNRQ92752 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
TNRQ92752 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TNRQ92752 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNRQ92752 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TNRQ92752 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNRQ92752 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms