Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms