Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCG3Q8WXD2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms