Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF31Q8WWY3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF31Q8WWY3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF31Q8WWY3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms