Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
C7orf43Q8WVR3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C7orf43Q8WVR3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C7orf43Q8WVR3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C7orf43Q8WVR3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C7orf43Q8WVR3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C7orf43Q8WVR3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C7orf43Q8WVR3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C7orf43Q8WVR3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
C7orf43Q8WVR3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms