Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD4Q8WVF5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms