Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE1Q8WV22 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms