Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBAR1Q8TDU6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBAR1Q8TDU6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 352.4 ms