Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HELQQ8TDG4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms