Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL3Q8TCT6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPPL3Q8TCT6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms