Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIN3Q8TB24 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms