Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TTLL11Q8NHH1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms