Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A3Q8NEV1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2A3Q8NEV1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms