Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PIK3C3Q8NEB9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms