Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HJURPQ8NCD3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HJURPQ8NCD3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms