Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC29Q8NA56 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms