Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNPLA1Q8N8W4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNPLA1Q8N8W4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms