Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHCHD4Q8N4Q1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHCHD4Q8N4Q1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
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