Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NME8Q8N427 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME8Q8N427 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
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