Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
VPS8Q8N3P4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
VPS8Q8N3P4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
VPS8Q8N3P4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms