Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00518Q8N0U6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00518Q8N0U6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms