Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY84

NIM1K, Serine/threonine-protein kinase NIM1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIM1KQ8IY84 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NIM1KQ8IY84 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NIM1KQ8IY84 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms