Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM48Q8IWZ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM48Q8IWZ4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms