Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK2Q8IWQ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRSK2Q8IWQ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.2 ms