Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms