Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC9A9Q8IVB4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A9Q8IVB4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A9Q8IVB4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms