Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLD3Q8IV08 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLD3Q8IV08 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms